Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms