Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms