Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsf1E9PWW9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms