Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms