Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms