Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms