Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp839E9PUU5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms