Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms