Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms