Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms