Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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