Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms