Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Gm20547B8JJN0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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Gm20547B8JJN0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
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Gm20547B8JJN0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gm20547B8JJN0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gm20547B8JJN0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gm20547B8JJN0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gm20547B8JJN0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm20547B8JJN0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm20547B8JJN0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20547B8JJN0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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