Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm6133B2RY53 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms