Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms