Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms