Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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