Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr29B1ARI9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms