Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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