Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms