Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms