Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms