Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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