Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms