Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms