Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
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