Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms