Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac6Q9Z2V5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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