Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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