Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms