Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mbd1Q9Z2E2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms