Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema4fQ9Z123 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4fQ9Z123 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms