Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stau1Q9Z108 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stau1Q9Z108 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stau1Q9Z108 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms