Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms