Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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