Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp2Q9Z0E6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms