Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PapolbQ9WVP6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms