Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms