Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ArcQ9WV31 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ArcQ9WV31 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms