Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited4Q9WUL8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms