Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms