Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pfdn5Q9WU28 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pfdn5Q9WU28 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pfdn5Q9WU28 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pfdn5Q9WU28 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pfdn5Q9WU28 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pfdn5Q9WU28 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pfdn5Q9WU28 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pfdn5Q9WU28 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pfdn5Q9WU28 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pfdn5Q9WU28 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms