Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp18Q9WTV6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms