Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfebQ9R210 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms