Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfwd2Q9R1A8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms