Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms