Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms