Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms