Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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