Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms